98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0449 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  98.44 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  96.88 
 
 
64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  69.35 
 
 
64 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  58.06 
 
 
64 aa  79.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  40.98 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  40.98 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  40.98 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  40.98 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  40.98 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  40.98 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  40.98 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  43.33 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  42.19 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  42.62 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  36.51 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
65 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  35.94 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
62 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 
73 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
69 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  41.94 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  41.67 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  40 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  40 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  38.98 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2891  putative copper chaperone  33.9 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1537  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.330529  normal  0.80617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1993  hypothetical protein  32.2 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  35.71 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3559  heavy metal transport/detoxification protein  38 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  28.33 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
56 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  31.67 
 
 
850 aa  43.5  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  33.93 
 
 
70 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  28.33 
 
 
133 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  35.09 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  28.33 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
70 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2293  Heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0133812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0448  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.268812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0415  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  37.93 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  30.51 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2906  Heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3214  Heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  42.59 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  37.93 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  27.12 
 
 
81 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>