195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2465 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
68 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  53.03 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 
73 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  45 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  47.46 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  47.46 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
70 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  45.31 
 
 
66 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
69 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  37.84 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  38.71 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  44.26 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  40.98 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  36.92 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  47.62 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
852 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  39.06 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
65 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
108 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
835 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  56.41 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  38.71 
 
 
792 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
859 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
833 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
839 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  56.41 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
976 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  39.68 
 
 
819 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  39.39 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  35.38 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  43.55 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06720  copper chaperone  33.82 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00676012  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  40.32 
 
 
792 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
800 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
1182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  43.08 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  40.98 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
867 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  44.62 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
833 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
799 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
894 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  38.71 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  38.71 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  37.1 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
799 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  37.1 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>