193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0663 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  66.15 
 
 
65 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  60 
 
 
65 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  63.08 
 
 
65 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  63.08 
 
 
65 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  64.62 
 
 
65 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 
65 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 
65 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  67.74 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  64.62 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 
64 aa  69.3  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  50.79 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  57.63 
 
 
79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 
63 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 
63 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  54.24 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  57.63 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  52.46 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  55.36 
 
 
70 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  50.85 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  53.57 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  40.32 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  42.59 
 
 
56 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  43.86 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  40.98 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  49.09 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  37.1 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
73 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  49.09 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  44.26 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  49.09 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  49.09 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  49.09 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  49.09 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 
62 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  37.93 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  38.46 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  43.55 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  38.71 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 
81 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.44 
 
 
67 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.44 
 
 
68 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
64 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  43.08 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  40.98 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  41.94 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  36.67 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  36.67 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  36.67 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  43.64 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  35 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  41.67 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  41.94 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  41.67 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  36.67 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  41.54 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  40.98 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>