More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4520 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
97 aa  192  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  77.32 
 
 
97 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  62.34 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1705  Heavy metal transport/detoxification protein  63.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0720999  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5319  Heavy metal transport/detoxification protein  63.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
740 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  37.93 
 
 
560 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
65 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  48.48 
 
 
689 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
827 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  46.38 
 
 
1182 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  47.3 
 
 
829 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  45.21 
 
 
732 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  50 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  33.68 
 
 
872 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.27 
 
 
855 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
741 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  32.98 
 
 
562 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  31.52 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  43.28 
 
 
792 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  47.06 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  41.79 
 
 
792 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  43.75 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
829 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  46.77 
 
 
66 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  41.54 
 
 
561 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  47.22 
 
 
827 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  40.96 
 
 
748 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  44.29 
 
 
913 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
800 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  46.97 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  41.43 
 
 
939 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
833 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  41.43 
 
 
826 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  41.89 
 
 
817 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
799 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
745 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  48.44 
 
 
824 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  38.67 
 
 
565 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
732 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  40.79 
 
 
836 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  40.79 
 
 
836 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  46.38 
 
 
807 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
1013 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  41.43 
 
 
907 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  38.57 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  37.5 
 
 
564 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  37.5 
 
 
564 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  42.37 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
835 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  39.06 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 
839 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
790 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
826 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  39.06 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  40.85 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  50.77 
 
 
827 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  45.45 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  35.23 
 
 
891 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
835 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
1040 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
836 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
839 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  31.52 
 
 
562 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  33.78 
 
 
819 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3167  Heavy metal transport/detoxification protein  40.85 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
778 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
835 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  43.08 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  44.62 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
767 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
797 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  40.68 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
762 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  38.57 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>