251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1163 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 70 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  52.31 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  56.92 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  56.67 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  61.02 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 69 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  56.45 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  50 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  45.59 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  50.79 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  49.25 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  55.36 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  46.03 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  51.47 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  46.03 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  46.03 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  47.54 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 856 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  47.54 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  51.72 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  49.25 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  41.43 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 		 872 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 		 804 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  36.36 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 841 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 		 473 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  47.17 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 839 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 734 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  50.85 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  33.87 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 750 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  40 
 
 		 817 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  34.43 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  44.26 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 894 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  38.24 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  44.62 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  42.37 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 789 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  49.23 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  41.54 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>