72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1877 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
67 aa  138  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  35.94 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  36.36 
 
 
69 aa  50.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  39.58 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 
68 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  37.5 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  32.26 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0685  heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 
68 aa  48.9  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100709  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  34.38 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  34.43 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2891  putative copper chaperone  34.92 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1537  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.330529  normal  0.80617 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  40.43 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  35.94 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  32.73 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  38.18 
 
 
752 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  31.25 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  48.84 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  35.42 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 
77 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  30.65 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  30.65 
 
 
954 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  29.23 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
752 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  29.23 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  46 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  26.56 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  30.91 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  35.29 
 
 
117 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
73 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  32.81 
 
 
100 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0131  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  28.79 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  28.36 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  35.48 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  42.55 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  30.3 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  31.25 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  27.27 
 
 
68 aa  40  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  34.92 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  35.42 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  30 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  35.85 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 
68 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 
68 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 
68 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>