79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1537 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1537  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 66 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.330529  normal  0.80617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2891  putative copper chaperone  100 
 
 		 66 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  43.94 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  35.94 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0131  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 740 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 913 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  35.48 
 
 		 742 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  31.58 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 744 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 971 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 744 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  33.9 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 744 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  33.9 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  33.9 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  33.9 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  28.12 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  32.2 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0716  heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.162111  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  37.7 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 850 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 744 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  33.33 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  29.23 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  30.88 
 
 		 68 aa  42  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 832 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 800 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  28.57 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  26.98 
 
 		 69 aa  40.8  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 833 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 833 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 833 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 833 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  33.33 
 
 		 833 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  27.87 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  29.51 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  30.43 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  27.12 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 807 aa  40  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 835 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 228 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  35.29 
 
 		 73 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 473 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>