161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0323 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
66 aa  127  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2186  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  43.55 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2891  putative copper chaperone  42.62 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1537  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.330529  normal  0.80617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
65 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  46.97 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  44.44 
 
 
71 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  40 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  40 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  40 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  40 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  40 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  40.62 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  40.62 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  40 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  40.62 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
939 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  45.16 
 
 
907 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  36.36 
 
 
907 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  41.27 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
971 aa  48.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  39.06 
 
 
68 aa  48.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
913 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
66 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
70 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
852 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  34.85 
 
 
834 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  34.85 
 
 
834 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  34.85 
 
 
834 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
834 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  41.67 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  34.85 
 
 
834 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  34.85 
 
 
834 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
835 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  34.85 
 
 
834 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  34.85 
 
 
834 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1150  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455128  hitchhiker  0.000000264701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  34.85 
 
 
834 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
725 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
840 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  37.1 
 
 
955 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  37.1 
 
 
961 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  36.07 
 
 
955 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
1013 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
946 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
839 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  39.06 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  44.26 
 
 
832 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
1021 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
1021 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  40.91 
 
 
561 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  29.85 
 
 
74 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  34.92 
 
 
69 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
732 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  30.77 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
855 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
821 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  38.81 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  29.85 
 
 
732 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  34.85 
 
 
833 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
790 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  37.5 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  40.91 
 
 
561 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  29.23 
 
 
1196 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
747 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
64 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
824 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  34.85 
 
 
833 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>