56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0716 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0716  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 69 aa  140  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.162111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  48.28 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0611  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0501148  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  35 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  30.16 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  30.16 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  29.51 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0685  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100709  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  27.87 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1346  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  27.87 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  27.87 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  30.77 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  32.26 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2891  putative copper chaperone  32.26 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1537  heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.330529  normal  0.80617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  28.57 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  31.75 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  34.85 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  31.03 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  29.69 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  29.51 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  29.51 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  34.43 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  24.59 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 		 133 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  32.76 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  28.33 
 
 		 69 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  38.1 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0613  heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000293526  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  28.17 
 
 		 827 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  29.09 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0599  heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000060559  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  29.09 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  31.15 
 
 		 86 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 65 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 73 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  30.16 
 
 		 65 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  38.1 
 
 		 810 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>