25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0685 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0685  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 68 aa  133  9e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100709  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1346  heavy metal transport/detoxification protein  64.06 
 
 		 68 aa  87.4  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0613  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000293526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0599  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000060559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0611  Heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0501148  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0716  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.162111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  32.73 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  30.91 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  40 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  25.81 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  30.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  36.07 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 867 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0691  Heavy metal transport/detoxification protein  31.51 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  37.31 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  30.65 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  40 
 
 		 68 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>