259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1150 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1150  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455128  hitchhiker  0.000000264701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  61.02 
 
 		 913 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  60.34 
 
 		 939 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  54.55 
 
 		 907 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  55.56 
 
 		 907 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  60.34 
 
 		 955 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  58.62 
 
 		 961 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  58.62 
 
 		 955 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  42.42 
 
 		 834 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  43.94 
 
 		 832 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  40.91 
 
 		 834 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  40.91 
 
 		 834 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 834 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  40.91 
 
 		 834 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  40.91 
 
 		 834 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  40.91 
 
 		 834 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  40.91 
 
 		 834 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  40.91 
 
 		 834 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  43.94 
 
 		 833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  43.94 
 
 		 833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  43.94 
 
 		 833 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  43.94 
 
 		 833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  49.21 
 
 		 792 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  43.94 
 
 		 833 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  47.62 
 
 		 792 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  47.46 
 
 		 844 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 867 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  49.15 
 
 		 833 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 835 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 732 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 		 841 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 827 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  45.07 
 
 		 732 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  39.39 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 840 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 850 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 		 836 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  46.27 
 
 		 915 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 1182 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 747 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 797 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 740 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 790 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 852 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 826 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 741 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 807 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  37.04 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 835 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 855 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 925 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  50 
 
 		 819 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 839 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 791 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 1040 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  46.77 
 
 		 971 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 1061 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 1061 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 793 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 976 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 		 946 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 1061 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 1063 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  43.94 
 
 		 1061 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  43.94 
 
 		 1063 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  39.39 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 1021 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 1021 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 		 860 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 937 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 824 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 762 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 		 790 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 762 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 767 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  43.64 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 762 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 1071 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  46.77 
 
 		 782 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  43.33 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 762 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 1013 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  49.25 
 
 		 765 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 859 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 872 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  38.24 
 
 		 902 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>