More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0166 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  100 
 
 		 91 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  85.71 
 
 		 91 aa  157  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  94.51 
 
 		 91 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  94.51 
 
 		 91 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  94.51 
 
 		 91 aa  140  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  94.51 
 
 		 91 aa  140  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  94.51 
 
 		 91 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  94.51 
 
 		 91 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  82.42 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  76.92 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  89.01 
 
 		 91 aa  130  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  86.81 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  86.81 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  83.52 
 
 		 91 aa  124  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  63.74 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  66.29 
 
 		 94 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  84.06 
 
 		 90 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  63.04 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  61.11 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  73.24 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  60.67 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  74.65 
 
 		 95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  74.65 
 
 		 95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  55.06 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  58.43 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  56.04 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  56.04 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  52.69 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  58.9 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  48.35 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  52.05 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  50 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  46.81 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  54.29 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  53.25 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  48.86 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  45.56 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  49.3 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  36.11 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 818 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  42.47 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  39.33 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  39.33 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  39.33 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  34.29 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  35.71 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 821 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  38.71 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  52.38 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  37.08 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  42.19 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  44.29 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.1 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  43.08 
 
 		 833 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  42.19 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  37.68 
 
 		 954 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 871 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  37.78 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 797 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  46.88 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 891 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  32.39 
 
 		 798 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  32.39 
 
 		 798 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 866 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 759 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 942 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 838 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 1087 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 759 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 890 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2967  heavy metal transport/detoxification protein  38.95 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.986526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 1071 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 758 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.94 
 
 		 798 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 802 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 806 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 815 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 855 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 		 938 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 806 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 836 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 837 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  37.7 
 
 		 805 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  37.7 
 
 		 805 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  37.7 
 
 		 805 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  37.7 
 
 		 805 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>