194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4796 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  100 
 
 		 94 aa  187  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  57.45 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  55.06 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  58.43 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  60.47 
 
 		 98 aa  103  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  54.26 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  56.18 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  57.78 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  51.69 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  61.97 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  55.06 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  63.24 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  55.06 
 
 		 100 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  56.18 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  56.18 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  56.18 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  56.18 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  56.18 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  56.18 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  61.76 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  61.76 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  54.44 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  60.56 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  56.18 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  55.06 
 
 		 91 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  55.06 
 
 		 91 aa  95.9  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  60.29 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  50.56 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  64.71 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  47.95 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  56.34 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  52.33 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  46.51 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  45.78 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  55.07 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  44.19 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  44.93 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  42.17 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  43.18 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  46.67 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  42.25 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  44.83 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  38.2 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  34.83 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 		 793 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 1087 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.1 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 699 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 816 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 825 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  42.86 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 805 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 1071 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  36.51 
 
 		 954 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 868 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  35.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  32.26 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 795 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  30.99 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  28.99 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 939 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 818 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  32.79 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.03 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  35.94 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  28.77 
 
 		 891 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 761 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 849 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  29.41 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  29.85 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 		 820 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 785 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  39.06 
 
 		 833 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  34.38 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 759 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 711 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 759 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 812 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 839 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6226  Heavy metal transport/detoxification protein  28.89 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 782 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 		 872 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  31.15 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  31.15 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 758 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 762 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 837 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  32.47 
 
 		 782 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 748 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3374  heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.096609  normal  0.701587 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 782 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>