61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2126 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2126  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  45.24 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  40.96 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  39.19 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  39.19 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  39.19 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  39.19 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2967  heavy metal transport/detoxification protein  35.96 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.986526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2788  heavy metal transport/detoxification protein  38.82 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.863319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 925 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1407  mercuric transport periplasmic protein MerP, putative  40 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2871  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 821 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  39.29 
 
 		 742 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.1 
 
 		 826 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  42.19 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  34.25 
 
 		 798 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  35 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 797 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 909 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  34.25 
 
 		 798 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1680  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  34.57 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 1021 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 1021 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 744 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 740 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 1013 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 1182 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  45.1 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 946 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  43.75 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  30.88 
 
 		 872 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 748 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 937 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  32.47 
 
 		 898 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.1 
 
 		 833 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  28.42 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 838 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01270  putative metal-binding protein  38.98 
 
 		 68 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  34.72 
 
 		 798 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.63 
 
 		 473 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  32.76 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 867 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  36.36 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 739 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 799 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 799 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 806 aa  40.8  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 828 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  29.73 
 
 		 228 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 800 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.33 
 
 		 915 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 861 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  32.14 
 
 		 75 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 		 758 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>