More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1232 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  45.31 
 
 
833 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  51.47 
 
 
795 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
826 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
838 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  49.28 
 
 
806 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
836 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  49.25 
 
 
806 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0531  copper-translocating P-type ATPase  43.42 
 
 
723 aa  67  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0398615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  45.95 
 
 
828 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
837 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  46.88 
 
 
797 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
821 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
871 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  37.18 
 
 
802 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  37.18 
 
 
802 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  43.42 
 
 
805 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  43.42 
 
 
805 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  43.42 
 
 
805 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  43.42 
 
 
805 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 
824 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 
817 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.42 
 
 
805 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  43.42 
 
 
805 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  43.42 
 
 
805 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  43.42 
 
 
806 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
798 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 
942 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
820 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
894 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
976 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
758 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
824 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.82 
 
 
794 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
837 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  38.16 
 
 
954 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
751 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
866 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
758 aa  61.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  44.29 
 
 
828 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  38.67 
 
 
798 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  38.67 
 
 
798 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
797 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
831 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01481  putative P-type ATPase transporter for copper  35.06 
 
 
764 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
839 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
861 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
887 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
803 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0133  putative P-type ATPase transporter for copper  35.53 
 
 
768 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.57861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
857 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  36.9 
 
 
743 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
938 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4522  heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  37.88 
 
 
817 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
759 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
759 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  46.27 
 
 
748 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  46.97 
 
 
798 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
786 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  42.47 
 
 
889 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.47 
 
 
889 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
837 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
752 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
836 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 
821 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
885 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
890 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
795 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
753 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  42.65 
 
 
828 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
805 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 
866 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1219  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 
196 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4383  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 
196 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
805 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4361  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 
196 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2980  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 
196 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
1021 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  30.56 
 
 
805 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  36.51 
 
 
765 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
1021 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
837 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
814 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
835 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 
746 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1637  copper(heavy metal)-transporting P-type ATPase  31.76 
 
 
786 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337983  hitchhiker  0.000242946 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
851 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 
804 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  42.03 
 
 
737 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6538  heavy metal translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
785 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451318  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
818 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
724 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  37.31 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
762 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 
786 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0219454  hitchhiker  0.00108055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
785 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1164  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
719 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
782 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>