More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1665 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1637  copper(heavy metal)-transporting P-type ATPase  65.45 
 
 
786 aa  982    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337983  hitchhiker  0.000242946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  64.94 
 
 
786 aa  976    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0219454  hitchhiker  0.00108055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1665  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
774 aa  1584    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000242647  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  40.5 
 
 
792 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  40.83 
 
 
790 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  40.13 
 
 
817 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  40.21 
 
 
792 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
796 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  40.4 
 
 
748 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  39.18 
 
 
740 aa  485  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  39.87 
 
 
741 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  39.47 
 
 
789 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  38.74 
 
 
802 aa  482  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  41.62 
 
 
730 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  41.62 
 
 
730 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  41.42 
 
 
816 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  39.74 
 
 
793 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  38.74 
 
 
802 aa  482  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  40.45 
 
 
813 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  39.47 
 
 
732 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  40.75 
 
 
790 aa  479  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  38.83 
 
 
795 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  36.61 
 
 
805 aa  476  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  39.37 
 
 
799 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  40.05 
 
 
791 aa  472  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
732 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
797 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  36.81 
 
 
743 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  36.18 
 
 
797 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 
799 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.26 
 
 
872 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  36.98 
 
 
798 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.8 
 
 
794 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
803 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
800 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  39.35 
 
 
835 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  36.58 
 
 
750 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  38.42 
 
 
1061 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
759 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  38.18 
 
 
1063 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  40.26 
 
 
1040 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
759 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  36.88 
 
 
805 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  38.06 
 
 
1061 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
1061 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  37.97 
 
 
971 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  37.97 
 
 
724 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  36.88 
 
 
805 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  36.88 
 
 
955 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  38.06 
 
 
1061 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  36.72 
 
 
889 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.8 
 
 
889 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
1063 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  36.75 
 
 
805 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  36.81 
 
 
797 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  36.75 
 
 
805 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  36.71 
 
 
961 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  35.93 
 
 
752 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  38.03 
 
 
799 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  36.61 
 
 
806 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  36.59 
 
 
955 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  36.75 
 
 
805 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  34.68 
 
 
753 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  38.2 
 
 
782 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  36.39 
 
 
817 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
757 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  36.7 
 
 
805 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  36.88 
 
 
806 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 
806 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  38.58 
 
 
799 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  38.2 
 
 
782 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  38.39 
 
 
793 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.52 
 
 
796 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  38.61 
 
 
804 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  39.14 
 
 
801 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  39.64 
 
 
748 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  39.46 
 
 
937 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  39.3 
 
 
946 aa  452  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  37.01 
 
 
832 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
767 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
815 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  36.63 
 
 
821 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  36.55 
 
 
827 aa  445  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  36.33 
 
 
758 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  37.78 
 
 
794 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
1021 aa  445  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
1182 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
1021 aa  445  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.83 
 
 
819 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
894 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  34.95 
 
 
828 aa  436  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  36.5 
 
 
798 aa  439  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  36.5 
 
 
798 aa  439  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  36.77 
 
 
837 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
758 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  36.72 
 
 
836 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  37.55 
 
 
833 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  35.27 
 
 
828 aa  436  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  36.48 
 
 
831 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  38.52 
 
 
834 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>