243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1338 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1338  heavy metal-binding domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  259  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0080  heavy metal transport/detoxification protein  53.91 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3641  heavy metal transport/detoxification protein  47.86 
 
 		 158 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  44.36 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3167  Heavy metal transport/detoxification protein  47.83 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  46.74 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  36.3 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  33.72 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  36 
 
 		 699 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  38.27 
 
 		 849 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 760 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  37.36 
 
 		 954 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 797 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.6 
 
 		 833 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 806 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 806 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 806 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  42.86 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  29.23 
 
 		 823 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 818 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 942 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 821 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 938 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4423  heavy metal translocating P-type ATPase  31.76 
 
 		 817 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332759  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  28.38 
 
 		 889 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  28.38 
 
 		 889 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 831 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 836 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 758 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  28.95 
 
 		 743 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 709 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  38.33 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  38.71 
 
 		 744 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 837 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 936 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  37.31 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  37.68 
 
 		 1182 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 797 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 837 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  37.8 
 
 		 755 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  28.74 
 
 		 794 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 797 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 826 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 838 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 826 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 868 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 		 807 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 799 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  32.04 
 
 		 907 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 835 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 694 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 835 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 837 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  32.88 
 
 		 761 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 885 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  32.65 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 		 734 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 794 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 758 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  33.8 
 
 		 1071 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  35 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 798 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 732 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  33 
 
 		 716 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 837 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 		 800 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 		 795 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 798 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  32 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 876 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  34.43 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 801 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  37.97 
 
 		 745 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 872 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 799 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 711 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  28.28 
 
 		 803 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2409  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 816 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.876205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 926 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  32.1 
 
 		 795 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3375  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 779 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 811 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>