More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4423 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2990  heavy metal translocating P-type ATPase  48.69 
 
 
756 aa  674    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  64.4 
 
 
876 aa  930    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4423  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
817 aa  1615    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332759  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2845  heavy metal translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
775 aa  635    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2195  heavy metal translocating P-type ATPase  45.73 
 
 
756 aa  599  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
836 aa  499  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.75 
 
 
797 aa  489  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
826 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  35.7 
 
 
797 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  35.1 
 
 
798 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  34.83 
 
 
743 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  39.1 
 
 
826 aa  474  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  35.37 
 
 
942 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
845 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.33 
 
 
794 aa  463  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  35.7 
 
 
821 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
803 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  34.18 
 
 
815 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  34.8 
 
 
798 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  34.8 
 
 
798 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
837 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  37.56 
 
 
837 aa  458  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  35.97 
 
 
740 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  35.83 
 
 
747 aa  455  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  35.71 
 
 
742 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  32.62 
 
 
758 aa  450  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
786 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
804 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  37.42 
 
 
849 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  35.42 
 
 
836 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  34.23 
 
 
817 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 
838 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  33.72 
 
 
805 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1925  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
838 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.715176  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  33.08 
 
 
866 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  36.6 
 
 
872 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1383  heavy metal translocating P-type ATPase  38.59 
 
 
745 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.457805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  37.85 
 
 
1071 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  35.66 
 
 
831 aa  439  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  35.19 
 
 
802 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  35.19 
 
 
802 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
814 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.02 
 
 
818 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
752 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  37.08 
 
 
795 aa  436  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.56 
 
 
796 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  34.11 
 
 
806 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  32.49 
 
 
894 aa  430  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  34.52 
 
 
836 aa  432  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.93 
 
 
732 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  33.89 
 
 
806 aa  432  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  34.64 
 
 
976 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  36.17 
 
 
816 aa  431  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  35.68 
 
 
813 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  33.46 
 
 
805 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
840 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  34.46 
 
 
857 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  35.61 
 
 
827 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.16 
 
 
833 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  33.64 
 
 
806 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  34.83 
 
 
885 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  36.39 
 
 
821 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  31.81 
 
 
889 aa  429  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  35.88 
 
 
799 aa  429  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.46 
 
 
805 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  33.46 
 
 
805 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  34.04 
 
 
828 aa  423  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  35.17 
 
 
826 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  32.23 
 
 
839 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
759 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  36.09 
 
 
802 aa  426  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  35.49 
 
 
835 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  33.25 
 
 
805 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  32.7 
 
 
753 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
831 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
827 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  32.37 
 
 
759 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  33.07 
 
 
723 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  34.57 
 
 
860 aa  422  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
817 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
817 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  35.15 
 
 
824 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  32.37 
 
 
759 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  32.17 
 
 
723 aa  422  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  40.59 
 
 
792 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
827 aa  418  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  34.04 
 
 
762 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  36.06 
 
 
834 aa  419  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  33.54 
 
 
828 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
790 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  35.1 
 
 
834 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  40.59 
 
 
800 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
835 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  35.73 
 
 
820 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.3 
 
 
889 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  33.98 
 
 
755 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 
811 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  33.8 
 
 
759 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>