89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1095 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 138 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3167  Heavy metal transport/detoxification protein  94.31 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0080  heavy metal transport/detoxification protein  59.29 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3641  heavy metal transport/detoxification protein  53.21 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  41.22 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1338  heavy metal-binding domain-containing protein  47.31 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  33.05 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 849 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  40.85 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  32.86 
 
 		 954 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 811 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 811 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 938 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  39.13 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 829 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  31.43 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 1087 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  33.85 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 885 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 743 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 826 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 821 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  30.3 
 
 		 823 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  32.26 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  30.3 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  25.71 
 
 		 798 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  32.26 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  25.71 
 
 		 798 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  31.17 
 
 		 742 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0990  heavy metal translocating P-type ATPase  29.41 
 
 		 803 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  29.21 
 
 		 826 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  32 
 
 		 836 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  28.44 
 
 		 839 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  30.3 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  27.69 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  34.85 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 836 aa  42.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 807 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 795 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 837 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  32.26 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  37.5 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  29.41 
 
 		 754 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 857 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  28.57 
 
 		 71 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  36.62 
 
 		 907 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  37.63 
 
 		 847 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  26.15 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  29.69 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  29.58 
 
 		 838 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 860 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  29.03 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 821 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  29.03 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  25.71 
 
 		 758 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  30 
 
 		 345 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  27.87 
 
 		 889 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  30.88 
 
 		 815 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 760 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  34.38 
 
 		 898 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 909 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 861 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 797 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 786 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0219454  hitchhiker  0.00108055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  35.71 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  26.15 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1637  copper(heavy metal)-transporting P-type ATPase  31.67 
 
 		 786 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337983  hitchhiker  0.000242946 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0303  heavy metal transport/detoxification protein  25.4 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 816 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1562  heavy metal translocating P-type ATPase  28.36 
 
 		 773 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1507  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 837 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  29.85 
 
 		 835 aa  40  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 734 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 821 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 70 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0423  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 		 71 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  30.3 
 
 		 65 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>