293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4424 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 71 aa  146  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 826 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  44.44 
 
 		 565 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 861 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 817 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 824 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1665  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 774 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000242647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 724 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 836 aa  53.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 		 801 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  43.08 
 
 		 561 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 786 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0219454  hitchhiker  0.00108055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 802 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 813 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  31.34 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  37.31 
 
 		 547 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.29 
 
 		 805 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  35.29 
 
 		 805 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  35.29 
 
 		 805 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  35.29 
 
 		 805 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  35.94 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  35.29 
 
 		 805 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  35.29 
 
 		 805 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  35.29 
 
 		 805 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  36.92 
 
 		 561 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3375  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 779 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  37.31 
 
 		 547 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 750 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  33.33 
 
 		 954 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  36.76 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 751 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1637  copper(heavy metal)-transporting P-type ATPase  36.21 
 
 		 786 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337983  hitchhiker  0.000242946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  34.33 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 889 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 806 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 890 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 876 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  51.22 
 
 		 564 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  34.33 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 752 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  51.22 
 
 		 564 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 806 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  51.22 
 
 		 561 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 806 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 802 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  33.85 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 889 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 837 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 802 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  51.22 
 
 		 561 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 796 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 831 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 806 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 823 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 837 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 753 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 942 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  33.85 
 
 		 799 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 798 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 976 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4626  heavy metal translocating P-type ATPase  31.75 
 
 		 754 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.617338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 744 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 798 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 811 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 811 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 699 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 		 621 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 837 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 748 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 807 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  35.94 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 817 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  34.92 
 
 		 1182 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3759  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 842 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475316  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  28.79 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  28.79 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 836 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  33.85 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 754 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 748 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 807 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0990  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 803 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  32.81 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  30.77 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2195  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 756 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 885 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 807 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 821 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 786 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  28.79 
 
 		 789 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 1071 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0727  heavy metal translocating P-type ATPase  30.3 
 
 		 792 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000426608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 759 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>