86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3167 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3167  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  95 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0080  heavy metal transport/detoxification protein  59.29 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3641  heavy metal transport/detoxification protein  53.04 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  43.31 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1338  heavy metal-binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  30.51 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 		 849 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 938 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 885 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  40.85 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 1087 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  31.43 
 
 		 954 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 821 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 823 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  34.29 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  40.62 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  32.26 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  32.26 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 758 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  32.31 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 829 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 65 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 826 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  30.3 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  27.52 
 
 		 839 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0990  heavy metal translocating P-type ATPase  27.94 
 
 		 803 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  36.62 
 
 		 860 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  29.03 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 807 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  29.03 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  37.68 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  31.17 
 
 		 742 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  30.16 
 
 		 811 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 		 811 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 65 aa  42  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  27.69 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  30.56 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 795 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  37.14 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  37.1 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 743 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  32.81 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  31.43 
 
 		 91 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  31.43 
 
 		 91 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1562  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 		 773 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  31.43 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 72 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  36.62 
 
 		 907 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 857 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  31.43 
 
 		 91 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  31.43 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  31.43 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  26.98 
 
 		 836 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 837 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 837 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  22.86 
 
 		 798 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  26.15 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  29.87 
 
 		 699 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  22.86 
 
 		 798 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  31.43 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 		 816 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  28.57 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  30.43 
 
 		 835 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  31.43 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  21.43 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 748 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  30.43 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  30.65 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  28.09 
 
 		 826 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2086  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 744 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  26.15 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1577  heavy metal translocating P-type ATPase  30.99 
 
 		 793 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.708859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  30.99 
 
 		 793 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  30.95 
 
 		 907 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>