283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1555 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  44.66 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0080  heavy metal transport/detoxification protein  36.19 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3641  heavy metal transport/detoxification protein  32.43 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1338  heavy metal-binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  43.75 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  34.15 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  31.52 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3167  Heavy metal transport/detoxification protein  32.1 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 946 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  41.25 
 
 		 747 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  31.52 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  34.62 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 807 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 1021 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 1021 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 1013 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  36.71 
 
 		 939 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 937 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  41.94 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 814 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 1182 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 850 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  31.03 
 
 		 734 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  42.25 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 824 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.21 
 
 		 751 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 		 839 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  32.43 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  30.59 
 
 		 797 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  44.44 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 67 aa  48.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 855 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  33.01 
 
 		 561 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  42.03 
 
 		 817 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  30.88 
 
 		 560 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  41.67 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 1040 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 731 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  38.27 
 
 		 726 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 71 aa  47.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  38.33 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  38.33 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 938 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  41.38 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  43.08 
 
 		 955 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  31.94 
 
 		 857 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 816 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5319  Heavy metal transport/detoxification protein  35.87 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1705  Heavy metal transport/detoxification protein  35.87 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0720999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 783 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.58 
 
 		 797 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  32.88 
 
 		 561 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  43.08 
 
 		 961 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  37.66 
 
 		 833 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  28.18 
 
 		 872 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  34.38 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 814 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  34.18 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  33.78 
 
 		 561 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 750 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  33.75 
 
 		 743 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  33.78 
 
 		 561 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  33.78 
 
 		 561 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 		 838 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  33.78 
 
 		 561 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  37.88 
 
 		 907 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1150  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455128  hitchhiker  0.000000264701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  33.78 
 
 		 561 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 724 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 885 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  30.11 
 
 		 815 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  39.44 
 
 		 955 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  32.58 
 
 		 795 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 804 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  33.78 
 
 		 561 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  29.27 
 
 		 832 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  36.36 
 
 		 834 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  40.32 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  35.29 
 
 		 564 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>