More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1705 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1705  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 97 aa  193  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0720999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5319  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 97 aa  193  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  49.04 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  49.25 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 745 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  50.77 
 
 		 955 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  43.04 
 
 		 913 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  50.77 
 
 		 939 aa  57.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  43.66 
 
 		 792 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  49.23 
 
 		 961 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  42.17 
 
 		 829 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  49.23 
 
 		 955 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  45.68 
 
 		 841 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  42.03 
 
 		 792 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  44 
 
 		 747 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.21 
 
 		 833 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  50 
 
 		 833 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  50 
 
 		 833 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  50 
 
 		 833 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  50 
 
 		 833 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  50.77 
 
 		 907 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  50 
 
 		 833 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  46.38 
 
 		 767 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  45.07 
 
 		 852 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  46.38 
 
 		 762 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  47.76 
 
 		 832 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  46.38 
 
 		 762 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 816 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  46.38 
 
 		 762 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.27 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 855 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  44.93 
 
 		 762 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 826 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  46.15 
 
 		 907 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  38.82 
 
 		 732 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 754 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.28 
 
 		 915 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 894 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 741 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  40.26 
 
 		 834 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  40.26 
 
 		 834 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  40.26 
 
 		 834 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 		 740 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  40.26 
 
 		 834 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  47.54 
 
 		 565 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  48.61 
 
 		 1040 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 799 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  37.35 
 
 		 835 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 827 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  40.26 
 
 		 834 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  40.26 
 
 		 834 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  40.26 
 
 		 834 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 946 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  40.26 
 
 		 834 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  49.25 
 
 		 807 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  40.26 
 
 		 834 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.76 
 
 		 732 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 		 1182 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 797 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 834 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  45.9 
 
 		 564 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  45.9 
 
 		 564 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  49.21 
 
 		 739 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  45.9 
 
 		 561 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.37 
 
 		 872 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  46.43 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  51.02 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  38.46 
 
 		 561 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  59.46 
 
 		 841 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  39.34 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  46.77 
 
 		 560 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  44.05 
 
 		 1013 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  36.36 
 
 		 742 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 835 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 827 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 		 829 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  49.23 
 
 		 795 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 1021 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 1021 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 790 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 841 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  33.82 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 		 797 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>