More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2455 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
108 aa  222  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  55.74 
 
 
345 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  47.76 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  47.76 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  48.39 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  50 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  43.94 
 
 
68 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  43.75 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  46.03 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  47.62 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  46.03 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2406  heavy metal binding protein  45.16 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  47.62 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  40.91 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  40.91 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  43.33 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2118  heavy metal binding protein  43.55 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  43.08 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  44.93 
 
 
837 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
1087 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  42.5 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  38.1 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  39.06 
 
 
70 aa  53.9  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  34.48 
 
 
954 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
857 aa  53.5  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  49.18 
 
 
838 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
837 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  38.81 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1665  heavy metal translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
774 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000242647  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
71 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  49.18 
 
 
833 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
811 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
811 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  30.77 
 
 
196 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  46.67 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  40 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
824 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
885 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
836 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  41.79 
 
 
66 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  42.62 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
871 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
752 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
754 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
759 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1925  copper-translocating P-type ATPase  45 
 
 
838 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.715176  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 
802 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
816 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
806 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  40.54 
 
 
891 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  40 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
836 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  48.33 
 
 
560 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
861 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  34.12 
 
 
942 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
750 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
835 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 
845 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
753 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  37.88 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
855 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
806 aa  48.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 
805 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 
805 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 
805 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 
805 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 
824 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  37.5 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 
805 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
938 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
806 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 
805 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  26.53 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
814 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  40.85 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 
805 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
813 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  39.68 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  36.99 
 
 
817 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
805 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>