58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0412 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0412  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
71 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0423  heavy metal transport/detoxification protein  80 
 
 
71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0303  heavy metal transport/detoxification protein  78.57 
 
 
70 aa  106  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0484  heavy metal transport/detoxification protein  72.86 
 
 
98 aa  105  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.591336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1507  heavy metal transport/detoxification protein  74.65 
 
 
71 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
723 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
723 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 
723 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  32.76 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  32.81 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  32.81 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  34.55 
 
 
954 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
744 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 
724 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  34.33 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  30.36 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
889 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  37.25 
 
 
861 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  45.71 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  29.82 
 
 
798 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  29.31 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  29.82 
 
 
798 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
817 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
889 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  35.09 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  31.37 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  27.69 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  29.85 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  28.07 
 
 
833 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  24.14 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
813 aa  40.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  28.26 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  34.69 
 
 
1071 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 
837 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  31.25 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  30.61 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2097  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.712519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  32.65 
 
 
820 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  32.81 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01591  putative P-type ATPase transporter for copper  45.95 
 
 
765 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.443919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  34.62 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  37.78 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  30.77 
 
 
69 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  26.79 
 
 
836 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  29.41 
 
 
802 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  42.5 
 
 
65 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
894 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>