256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4541 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
75 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  57.53 
 
 
78 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4522  heavy metal transport/detoxification protein  50.67 
 
 
80 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  46.15 
 
 
75 aa  60.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  40.58 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
942 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
806 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  35.29 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  35.29 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  35.29 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  35.29 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
806 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  32.31 
 
 
195 aa  52.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  38.24 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
837 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  38.24 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  40.85 
 
 
805 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  36.11 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  36.76 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0303  heavy metal transport/detoxification protein  30.88 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  38.24 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
798 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  36.36 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  35.29 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  36.36 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 
91 aa  50.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  32.35 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  33.82 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
795 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  30.67 
 
 
796 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  39.44 
 
 
805 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  39.44 
 
 
805 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  39.44 
 
 
805 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  39.44 
 
 
805 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  38.03 
 
 
805 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  37.88 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  39.44 
 
 
805 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  33.82 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
739 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  34.43 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  35.94 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  34.43 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
779 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
828 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  40 
 
 
68 aa  48.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
871 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  40.62 
 
 
954 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  27.54 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
793 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1507  heavy metal transport/detoxification protein  27.94 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2420  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  39.06 
 
 
833 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
802 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
837 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
802 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
821 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  35.94 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
1071 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
70 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
806 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  32.31 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  30.88 
 
 
798 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  37.14 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
836 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  30.88 
 
 
798 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  33.33 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 
71 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
894 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  32.31 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 
789 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  36.36 
 
 
1196 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01390  iron/copper transporter Atx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08880)  45.76 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
826 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
759 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  39.39 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
817 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
803 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
837 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
759 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  36.23 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  30.88 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
1087 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
806 aa  45.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
837 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
866 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01481  putative P-type ATPase transporter for copper  31.94 
 
 
764 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
797 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0423  heavy metal transport/detoxification protein  29.41 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0412  heavy metal transport/detoxification protein  30.36 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>