182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2420 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2420  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 68 aa  130  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2086  heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000331725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  50 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0315  hypothetical protein  55.77 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  40.3 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  38.1 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.44 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 861 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.44 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  37.1 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  37.1 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 826 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  38.33 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  38.33 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0659  heavy metal-binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  38.33 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 		 867 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0577  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 842 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.951619  normal  0.619407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 751 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 976 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 820 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 871 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3759  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 842 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475316  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 750 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  38.33 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 821 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 887 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  36.67 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  38.1 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  38.33 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 942 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  40.32 
 
 		 561 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 724 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5743  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 816 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 828 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  41.67 
 
 		 564 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  44.44 
 
 		 565 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  41.67 
 
 		 561 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 866 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  37.1 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 925 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  46.3 
 
 		 561 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  41.67 
 
 		 564 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  46.3 
 
 		 561 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  35 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 		 471 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  33.33 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  33.33 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  33.33 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  36.67 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  33.33 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 824 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 748 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 		 750 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 857 aa  43.5  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  33.33 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0727  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 792 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000426608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  34.92 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  26.56 
 
 		 836 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  27.87 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  31.67 
 
 		 759 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 805 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  41.67 
 
 		 561 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 889 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 889 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  41.67 
 
 		 561 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 742 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 1071 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  41.67 
 
 		 561 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  41.67 
 
 		 561 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  33.87 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>