124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2045 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 68 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2086  heavy metal transport/detoxification protein  65.15 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000331725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  49.25 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  40 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  39.68 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2420  Heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0315  hypothetical protein  54 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  44.26 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  42.19 
 
 		 69 aa  50.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  34.85 
 
 		 621 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  41.54 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.39 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 885 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 471 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 857 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  34.92 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  43.08 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  43.33 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 1071 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  43.33 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 876 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 738 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 861 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 866 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 891 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 837 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  38.33 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  35.29 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 811 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 811 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 871 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  26.56 
 
 		 765 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5743  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  35 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  28.33 
 
 		 837 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  32.31 
 
 		 805 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 758 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 942 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 825 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 		 499 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 976 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 694 aa  43.5  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 817 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 849 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 732 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  36.07 
 
 		 561 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 806 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01270  putative metal-binding protein  42.37 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 837 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 802 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 821 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 826 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 938 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  38.33 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  36.07 
 
 		 561 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 806 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 806 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  30.77 
 
 		 805 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  30.77 
 
 		 805 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  38.98 
 
 		 561 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 751 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  30.77 
 
 		 805 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  42.31 
 
 		 561 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  38.98 
 
 		 561 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  38.98 
 
 		 561 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.5 
 
 		 833 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  38.98 
 
 		 561 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  42.31 
 
 		 561 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  34.85 
 
 		 67 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 70 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  38.98 
 
 		 561 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  34.78 
 
 		 68 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  38.98 
 
 		 561 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  31.03 
 
 		 94 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  30.77 
 
 		 805 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>