More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0727 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  72.75 
 
 
789 aa  1139    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  50.19 
 
 
806 aa  719    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0727  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
792 aa  1515    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000426608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1442  heavy metal translocating P-type ATPase  61.35 
 
 
791 aa  922    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.153784  normal  0.0826398 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
802 aa  521  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  40.81 
 
 
836 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  39.09 
 
 
837 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.16 
 
 
794 aa  505  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  35.92 
 
 
802 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
828 aa  500  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  35.92 
 
 
802 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 
821 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 
885 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  36.5 
 
 
797 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
797 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  37.27 
 
 
798 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  37.95 
 
 
803 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
815 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  38.03 
 
 
799 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
817 aa  489  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  40.75 
 
 
826 aa  489  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  35.86 
 
 
828 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.84 
 
 
838 aa  488  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  36.27 
 
 
828 aa  486  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.83 
 
 
805 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
837 aa  480  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 
824 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
798 aa  479  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  34.32 
 
 
759 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.34 
 
 
894 aa  477  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  38.32 
 
 
750 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  34.32 
 
 
759 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
798 aa  479  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  36.21 
 
 
805 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  36.21 
 
 
805 aa  476  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  36.21 
 
 
805 aa  475  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  39.36 
 
 
831 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  36.21 
 
 
805 aa  476  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  36.21 
 
 
805 aa  475  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  39.49 
 
 
752 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  38.34 
 
 
786 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
976 aa  475  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
837 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  35.83 
 
 
806 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  36.08 
 
 
805 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  39.72 
 
 
820 aa  472  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  36.42 
 
 
806 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
748 aa  469  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  35.5 
 
 
818 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
841 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  37.3 
 
 
857 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  35.77 
 
 
743 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
796 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
839 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  36.74 
 
 
758 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
806 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  36.35 
 
 
942 aa  464  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
821 aa  462  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.78 
 
 
889 aa  466  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.92 
 
 
872 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  39.1 
 
 
849 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  39.7 
 
 
811 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  38.35 
 
 
753 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  36.12 
 
 
861 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  37.47 
 
 
836 aa  461  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  33.42 
 
 
889 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  39.7 
 
 
811 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  39.85 
 
 
814 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  38.99 
 
 
835 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
852 aa  459  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
827 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  46.37 
 
 
792 aa  458  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  37.97 
 
 
841 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  39.43 
 
 
833 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
840 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 
838 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  38.15 
 
 
795 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
816 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  38.64 
 
 
797 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  38.32 
 
 
834 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
814 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
758 aa  451  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  37.74 
 
 
835 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 
841 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  40.08 
 
 
793 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
833 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  41.57 
 
 
748 aa  445  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  35.5 
 
 
826 aa  445  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  38.38 
 
 
744 aa  443  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 
799 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 
827 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  35.34 
 
 
759 aa  445  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 
833 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  37.53 
 
 
826 aa  442  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0531  copper-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 
723 aa  442  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0398615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  46.21 
 
 
751 aa  442  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  38.79 
 
 
817 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  37 
 
 
761 aa  439  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  38.17 
 
 
827 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  36.15 
 
 
740 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>