57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0315 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0315  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  237  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2086  heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000331725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  24.44 
 
 
889 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  54 
 
 
68 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  24.44 
 
 
889 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  54 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2420  Heavy metal transport/detoxification protein  57.5 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  41.51 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  42.31 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  46.15 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.64 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  42.31 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  42.31 
 
 
68 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.36 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.36 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 
499 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  34.09 
 
 
866 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.62 
 
 
797 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  38.18 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  40.38 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5743  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  32.47 
 
 
471 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  27.47 
 
 
816 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  32.14 
 
 
818 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  47.73 
 
 
65 aa  43.5  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  37.74 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
887 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
876 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 
871 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  41.18 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  32.73 
 
 
760 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  32.69 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 
976 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  39.22 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  41.18 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2409  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
816 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.876205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  31.65 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 
815 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  34.25 
 
 
743 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  37.5 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 
867 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  36.36 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  50 
 
 
565 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 
807 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  27.06 
 
 
942 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.08 
 
 
751 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  33.93 
 
 
954 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  44.19 
 
 
560 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  29.55 
 
 
826 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  50 
 
 
564 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  50 
 
 
564 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>