155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0711 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 80 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  88.89 
 
 		 81 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0448  Heavy metal transport/detoxification protein  67.65 
 
 		 73 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.268812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  66.18 
 
 		 73 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0415  heavy metal transport/detoxification protein  67.65 
 
 		 73 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  57.97 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  39.39 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  46.38 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  41.94 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  34.18 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1164  heavy metal translocating P-type ATPase  32.05 
 
 		 719 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  37.7 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  40 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  56.41 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4881  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  33.8 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 894 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  39.44 
 
 		 829 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 833 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  36.21 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 		 855 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 861 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  38.33 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  36.67 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  35.19 
 
 		 471 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 762 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 830 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  36.84 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  31.75 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  39.74 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  40.38 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  28.38 
 
 		 806 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  36.67 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  35 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  36.23 
 
 		 792 aa  42  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  36.67 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  29.49 
 
 		 869 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  29.17 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>