More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4626 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4626  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 754 aa  1478    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.617338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1621  copper-translocating P-type ATPase  52.57 
 
 		 761 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.996333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  34.27 
 
 		 805 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  34.31 
 
 		 805 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  34.05 
 
 		 806 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  34.05 
 
 		 805 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  34.45 
 
 		 806 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  34.45 
 
 		 806 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  34.18 
 
 		 805 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  34.05 
 
 		 805 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  34.05 
 
 		 805 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  33.91 
 
 		 805 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  33.83 
 
 		 743 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  32.19 
 
 		 797 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 802 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  32.62 
 
 		 815 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 802 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  35.78 
 
 		 809 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2379  heavy metal translocating P-type ATPase  37.55 
 
 		 752 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000287597  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  32.89 
 
 		 750 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.51 
 
 		 798 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  36.52 
 
 		 740 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  32.82 
 
 		 799 aa  365  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  33.77 
 
 		 753 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  33.64 
 
 		 817 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  33.51 
 
 		 797 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  35.83 
 
 		 741 aa  359  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  33.88 
 
 		 808 aa  359  9e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  33.42 
 
 		 798 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  33.42 
 
 		 798 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  32.58 
 
 		 744 aa  358  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 		 814 aa  358  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  33.03 
 
 		 759 aa  356  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  35.85 
 
 		 747 aa  355  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  31.72 
 
 		 889 aa  355  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  32.8 
 
 		 818 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  37.69 
 
 		 831 aa  353  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  36.53 
 
 		 790 aa  353  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  35.51 
 
 		 767 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 807 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.29 
 
 		 796 aa  352  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 		 813 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.59 
 
 		 889 aa  351  4e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  31.99 
 
 		 894 aa  350  4e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  30.41 
 
 		 794 aa  350  7e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  32.6 
 
 		 803 aa  349  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 827 aa  349  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  34.7 
 
 		 837 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  33.07 
 
 		 954 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  32.59 
 
 		 752 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  36.04 
 
 		 748 aa  347  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  35.55 
 
 		 836 aa  347  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  34.03 
 
 		 942 aa  345  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  35.33 
 
 		 835 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  32.76 
 
 		 814 aa  345  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 821 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 804 aa  343  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  31.43 
 
 		 759 aa  343  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  31.43 
 
 		 759 aa  343  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  33.29 
 
 		 724 aa  343  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  31.91 
 
 		 740 aa  342  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  40.86 
 
 		 831 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  35.5 
 
 		 790 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  32.55 
 
 		 828 aa  342  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  38.28 
 
 		 801 aa  342  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  38.65 
 
 		 773 aa  342  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  35.7 
 
 		 946 aa  342  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 849 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  37.67 
 
 		 739 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0531  copper-translocating P-type ATPase  31.32 
 
 		 723 aa  341  2.9999999999999998e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0398615  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  31.78 
 
 		 742 aa  341  4e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  36.27 
 
 		 937 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  35.36 
 
 		 826 aa  340  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1836  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.15 
 
 		 808 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.048394 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  38.44 
 
 		 818 aa  340  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  34.35 
 
 		 907 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  34.06 
 
 		 786 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  36.97 
 
 		 1040 aa  340  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 		 836 aa  340  8e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  34.51 
 
 		 797 aa  340  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  35.35 
 
 		 817 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  33.95 
 
 		 907 aa  339  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  34.3 
 
 		 814 aa  339  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  31.59 
 
 		 828 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  37.48 
 
 		 781 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 		 811 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  37.48 
 
 		 781 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  32.41 
 
 		 826 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  33.07 
 
 		 828 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  32.49 
 
 		 905 aa  337  5e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  37.3 
 
 		 971 aa  337  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  37.8 
 
 		 804 aa  337  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  36.3 
 
 		 1061 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  36.3 
 
 		 1063 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  34.77 
 
 		 800 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  36.3 
 
 		 1063 aa  337  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  36.15 
 
 		 1071 aa  336  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  36.65 
 
 		 807 aa  336  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  35.08 
 
 		 837 aa  336  9e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0705  copper-translocating P-type ATPase  37.58 
 
 		 779 aa  336  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>