More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2379 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2379  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 752 aa  1488    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000287597  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4626  heavy metal translocating P-type ATPase  37.55 
 
 		 754 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.617338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1621  copper-translocating P-type ATPase  35.32 
 
 		 761 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.996333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.34 
 
 		 795 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  30.71 
 
 		 803 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  30.8 
 
 		 803 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  30.42 
 
 		 803 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  30.66 
 
 		 794 aa  302  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  29.01 
 
 		 799 aa  300  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  30.2 
 
 		 797 aa  300  8e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  29.7 
 
 		 799 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  32.32 
 
 		 849 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  29.7 
 
 		 799 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  28.9 
 
 		 799 aa  296  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  29.74 
 
 		 799 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  31.55 
 
 		 812 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  30.71 
 
 		 809 aa  295  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  29.83 
 
 		 799 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  29.91 
 
 		 807 aa  294  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  29.7 
 
 		 799 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  29.16 
 
 		 797 aa  293  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  29.72 
 
 		 791 aa  292  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  29.48 
 
 		 803 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  30.78 
 
 		 839 aa  291  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  30.52 
 
 		 806 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 815 aa  288  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 846 aa  288  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  29.42 
 
 		 802 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  31.86 
 
 		 839 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  30.07 
 
 		 806 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  29.52 
 
 		 813 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  29.42 
 
 		 802 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  32.02 
 
 		 835 aa  283  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  29.67 
 
 		 724 aa  283  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  29.82 
 
 		 790 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  29.03 
 
 		 885 aa  282  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  28.51 
 
 		 744 aa  281  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1442  heavy metal translocating P-type ATPase  33.19 
 
 		 791 aa  282  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.153784  normal  0.0826398 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  27.42 
 
 		 794 aa  281  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  28.65 
 
 		 798 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  28.72 
 
 		 805 aa  280  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  30.78 
 
 		 808 aa  280  8e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  32.64 
 
 		 827 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  33.43 
 
 		 724 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  30.99 
 
 		 826 aa  278  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  29.73 
 
 		 792 aa  278  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  31.45 
 
 		 872 aa  277  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 795 aa  277  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  31.54 
 
 		 807 aa  277  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  30.49 
 
 		 794 aa  276  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  32.16 
 
 		 793 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  32.6 
 
 		 732 aa  276  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  31.72 
 
 		 831 aa  275  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  28.78 
 
 		 753 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  33.84 
 
 		 751 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  33.74 
 
 		 834 aa  274  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  31.01 
 
 		 757 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  30.42 
 
 		 836 aa  274  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  26.99 
 
 		 815 aa  273  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  29.03 
 
 		 798 aa  273  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  28.63 
 
 		 792 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  29.03 
 
 		 798 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0531  copper-translocating P-type ATPase  29 
 
 		 723 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0398615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  28.86 
 
 		 894 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  27.9 
 
 		 976 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  28.44 
 
 		 796 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  27.7 
 
 		 759 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  27.7 
 
 		 759 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  31.11 
 
 		 799 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  31.11 
 
 		 799 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  28.61 
 
 		 799 aa  271  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  30.42 
 
 		 816 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  31.18 
 
 		 805 aa  270  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  31.89 
 
 		 799 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0705  copper-translocating P-type ATPase  32.64 
 
 		 779 aa  269  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  27.86 
 
 		 750 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  30.59 
 
 		 748 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  30.53 
 
 		 822 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  29.84 
 
 		 939 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  26.37 
 
 		 797 aa  269  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 838 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  28.67 
 
 		 752 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  30.97 
 
 		 816 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  32.43 
 
 		 787 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  30.52 
 
 		 837 aa  268  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  28.06 
 
 		 828 aa  267  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  27.58 
 
 		 826 aa  267  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  31.31 
 
 		 806 aa  267  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  32.21 
 
 		 758 aa  266  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 800 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  27.14 
 
 		 828 aa  266  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  30.83 
 
 		 790 aa  266  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  28.25 
 
 		 828 aa  266  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  27.61 
 
 		 791 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  28.14 
 
 		 828 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  31.78 
 
 		 814 aa  265  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  31.2 
 
 		 755 aa  265  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  31.11 
 
 		 811 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  34.14 
 
 		 857 aa  264  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  27.2 
 
 		 796 aa  264  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>