More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2575 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  45.67 
 
 
813 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  68.85 
 
 
806 aa  1073    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  46.74 
 
 
814 aa  662    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
775 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  45.36 
 
 
813 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  44.85 
 
 
818 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  45.11 
 
 
811 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
857 aa  1710    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  48.15 
 
 
792 aa  684    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  48.9 
 
 
768 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  48.82 
 
 
845 aa  697    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  48.96 
 
 
795 aa  697    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  48.5 
 
 
818 aa  668    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  49.08 
 
 
795 aa  698    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  48.9 
 
 
768 aa  691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  49.03 
 
 
796 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  48.85 
 
 
767 aa  694    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  45.33 
 
 
889 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  45.77 
 
 
823 aa  657    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  68.66 
 
 
793 aa  1085    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  46.74 
 
 
814 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  49.85 
 
 
857 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
817 aa  625  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 
836 aa  598  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  45.82 
 
 
818 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.01 
 
 
838 aa  598  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  49.47 
 
 
736 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  50.76 
 
 
823 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  48.25 
 
 
735 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  42.01 
 
 
836 aa  589  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  49.32 
 
 
787 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  49.02 
 
 
781 aa  588  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  50.46 
 
 
795 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  50.6 
 
 
755 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  51.98 
 
 
806 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  41.16 
 
 
942 aa  588  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  49.02 
 
 
781 aa  588  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  44.86 
 
 
894 aa  586  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  48.71 
 
 
735 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  49.85 
 
 
846 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  43.63 
 
 
758 aa  582  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  49.17 
 
 
804 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  49.62 
 
 
737 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  46.75 
 
 
786 aa  582  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  44.89 
 
 
753 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  49.47 
 
 
767 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  50.3 
 
 
788 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  41.52 
 
 
837 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  46.26 
 
 
797 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  47.68 
 
 
822 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  39.04 
 
 
889 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
837 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  50.08 
 
 
783 aa  574  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  48.07 
 
 
821 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  41.35 
 
 
829 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  47.31 
 
 
831 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  40.25 
 
 
798 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  50.32 
 
 
773 aa  572  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  38.67 
 
 
889 aa  572  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  44.14 
 
 
872 aa  570  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  50.68 
 
 
786 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  50.89 
 
 
724 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  49.09 
 
 
809 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  48.11 
 
 
810 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.51 
 
 
827 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  47.97 
 
 
816 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  41.79 
 
 
833 aa  565  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  47.87 
 
 
772 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  46.76 
 
 
954 aa  562  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  51.44 
 
 
793 aa  562  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  44.7 
 
 
752 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  42.44 
 
 
818 aa  561  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  47.66 
 
 
801 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  41.36 
 
 
820 aa  560  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.91 
 
 
797 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  49.4 
 
 
787 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  46.98 
 
 
976 aa  559  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  49.77 
 
 
755 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
885 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  51.98 
 
 
796 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
809 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  47.55 
 
 
798 aa  558  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  53.07 
 
 
1020 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  45.34 
 
 
821 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  47.56 
 
 
778 aa  555  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  40.53 
 
 
826 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
834 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
837 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
721 aa  549  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.83 
 
 
852 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
815 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  47.88 
 
 
751 aa  551  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  42.46 
 
 
743 aa  551  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
855 aa  551  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
759 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  45.55 
 
 
798 aa  547  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  44.03 
 
 
759 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
821 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  43.56 
 
 
814 aa  549  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  47.31 
 
 
815 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>