31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04045 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  100 
 
 		 814 aa  1669    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  38.85 
 
 		 831 aa  611  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  23.62 
 
 		 839 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  22.32 
 
 		 811 aa  141  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  24.57 
 
 		 848 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  23.47 
 
 		 853 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  22.18 
 
 		 853 aa  130  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  23.32 
 
 		 828 aa  126  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  22.54 
 
 		 841 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  22.43 
 
 		 855 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  23.04 
 
 		 857 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  22.27 
 
 		 843 aa  98.2  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  22.81 
 
 		 856 aa  91.3  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  21.65 
 
 		 877 aa  89.4  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  23.79 
 
 		 838 aa  89.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  21.96 
 
 		 829 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  24.12 
 
 		 828 aa  73.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  22.37 
 
 		 816 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10568  hypothetical protein  27.33 
 
 		 425 aa  51.6  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  39.33 
 
 		 1166 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 929 aa  47.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  29.84 
 
 		 914 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  33.62 
 
 		 409 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 999 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1059 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1084 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  27.03 
 
 		 942 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 1032 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 769 aa  44.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 924 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1105 aa  44.3  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>