114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1513 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  100 
 
 		 838 aa  1707    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  32.97 
 
 		 841 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  32.33 
 
 		 828 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  26.18 
 
 		 848 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  26.16 
 
 		 853 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  28.41 
 
 		 857 aa  238  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  24.52 
 
 		 855 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  26.19 
 
 		 839 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  25.43 
 
 		 853 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  24.58 
 
 		 843 aa  207  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  24.66 
 
 		 856 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  23.3 
 
 		 877 aa  181  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  23.43 
 
 		 816 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  20.63 
 
 		 831 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  23.96 
 
 		 814 aa  92.8  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  22.42 
 
 		 828 aa  92.4  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  22.94 
 
 		 829 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1094 aa  61.2  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 793 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 814 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  37.5 
 
 		 719 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 873 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  35.64 
 
 		 1045 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 874 aa  54.7  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 1016 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  37.17 
 
 		 1008 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  28 
 
 		 381 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1020 aa  52.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1046 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 924 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 780 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 788 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 999 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 958 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1023 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 922 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1059 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1169 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  19.94 
 
 		 811 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  29.87 
 
 		 1051 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 929 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1192 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1034 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 1019 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 792 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1165 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 955 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1031 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1081 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1004 aa  48.5  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1070 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  29.92 
 
 		 891 aa  48.1  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 751 aa  48.1  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 772 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1003 aa  48.1  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  36.36 
 
 		 1129 aa  47.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  30.25 
 
 		 879 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 1040 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 958 aa  47.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1077 aa  47.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  27.27 
 
 		 872 aa  47.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  27.69 
 
 		 709 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1050 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 1105 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 745 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1056 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 1119 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1093 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  25.66 
 
 		 849 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1107 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  33.81 
 
 		 1017 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.67 
 
 		 833 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 778 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1059 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1105 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  33.33 
 
 		 1874 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1119 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1008 aa  47  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 1083 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1082 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  30.89 
 
 		 914 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 1003 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1168 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1202 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  21.75 
 
 		 925 aa  45.8  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1059 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  26.19 
 
 		 808 aa  45.8  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1094 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 730 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1078 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  29.23 
 
 		 1005 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1072 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1152 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1006 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1090 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1097  hypothetical protein  32.2 
 
 		 276 aa  45.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1173 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1063 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1095 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>