44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1097 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1097  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1290  hypothetical protein  33.82 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.819425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 		 1040 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 955 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  38.33 
 
 		 824 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1105 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  36.14 
 
 		 1006 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 929 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1127 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1098 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 793 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 998 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  29.49 
 
 		 829 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1034 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1081 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1070 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 907 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 735 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 780 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1020 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  37.29 
 
 		 1120 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  28.47 
 
 		 1019 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1008 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1155 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  21.58 
 
 		 848 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 1078 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1139 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  29.89 
 
 		 1010 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 975 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 988 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 809 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  31.63 
 
 		 838 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10788  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  38.6 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 1146 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1161 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 806 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 791 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1051 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2401  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1046 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1153 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 1006 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  25.69 
 
 		 879 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>