133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2401 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2401  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08806  hypothetical protein  56.17 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0278  secreted protein  45.45 
 
 		 273 aa  238  6.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000164081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 999 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09683  hypothetical protein  31.07 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1057 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1073 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1006 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09688  hypothetical protein  22.94 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1016 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0367  hypothetical protein  24.05 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0070  hypothetical protein  26.29 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1008 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  30.51 
 
 		 829 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1037 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1021 aa  52.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1051 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1155 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 987 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1065 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1049 aa  52  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1770  hypothetical protein  29.73 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 887 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1070 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  26.96 
 
 		 1018 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 770 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1064 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1137 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1059 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1113 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1034 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1038 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0048  hypothetical protein  24.14 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 757 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1064 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 1008 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1188 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  32.5 
 
 		 1071 aa  48.9  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1071 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 1144 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1071 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 933 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  28.45 
 
 		 979 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1043 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 989 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1084 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  23.73 
 
 		 1123 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1135 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1013 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 957 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 780 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1165 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 999 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 1010 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  22.9 
 
 		 1003 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1116 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1072 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 992 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 1001 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  27.12 
 
 		 1010 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 1105 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 927 aa  45.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1128 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 1045 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1098 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  23.93 
 
 		 1095 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1933  hypothetical protein  22.56 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1023 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1153 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1038 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 1065 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  28.95 
 
 		 827 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 735 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1189 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1119 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1008 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2992  hypothetical protein  27.42 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 1038 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1027 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1219 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1107 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1093 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1139 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 1081 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 1084 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 996 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1173 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1168 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 929 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  31.45 
 
 		 895 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  34.83 
 
 		 977 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1012 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1010 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1046 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 		 791 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1024 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 958 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1110 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 888 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>