100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1856 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 792 aa  1605    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  34.34 
 
 		 821 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  36.59 
 
 		 802 aa  428  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  32.49 
 
 		 821 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  33.01 
 
 		 827 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 814 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 792 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 787 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  23.29 
 
 		 803 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.76 
 
 		 800 aa  82  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 790 aa  80.9  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 791 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 775 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 716 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 800 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 772 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 793 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 806 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 923 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 775 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 881 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  27.55 
 
 		 767 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 753 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 875 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 789 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 814 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  26.43 
 
 		 780 aa  68.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  27.6 
 
 		 719 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  25.22 
 
 		 872 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.28 
 
 		 701 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 874 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 791 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  22.94 
 
 		 897 aa  64.7  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  25.97 
 
 		 928 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 772 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 730 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 923 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 756 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 804 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  25.16 
 
 		 917 aa  58.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  25.13 
 
 		 860 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 897 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  25.13 
 
 		 859 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 1089 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 924 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  25.1 
 
 		 888 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 771 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  21.46 
 
 		 714 aa  54.3  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1177 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  24.92 
 
 		 822 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 831 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 866 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 786 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1019 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2226  hypothetical protein  21.77 
 
 		 740 aa  51.2  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000689812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 1063 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  31.9 
 
 		 856 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 1100 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1087 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 1087 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1079 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1103 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1070 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 1014 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 1032 aa  47.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 1110 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  21.82 
 
 		 777 aa  47.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1046 aa  47.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1019 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 1168 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1120 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 994 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1038 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1052 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1041 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1096 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5532  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1092 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0182385  normal  0.924407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  22.92 
 
 		 906 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 1123 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1119 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1013 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 989 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 763 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  23.4 
 
 		 1094 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1109 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1143 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 998 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1079 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1026 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.61 
 
 		 1063 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1148 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1192 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1161 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1163 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 1038 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 935 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 933 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  30.34 
 
 		 838 aa  44.3  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  29 
 
 		 857 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 779 aa  44.3  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>