More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4952 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1979 aa  998    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  100 
 
 		 1874 aa  3898    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 		 1186 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  24.04 
 
 		 1559 aa  124  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 1102 aa  109  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.99 
 
 		 1737 aa  109  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  41.72 
 
 		 1169 aa  102  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  38.26 
 
 		 1022 aa  102  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.68 
 
 		 1872 aa  98.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  41.41 
 
 		 1138 aa  97.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1008 aa  97.8  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1043 aa  96.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1127 aa  94.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  38.28 
 
 		 1073 aa  92.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1038 aa  93.2  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1047 aa  92.8  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  41.09 
 
 		 1059 aa  91.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  35.94 
 
 		 1065 aa  90.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1059 aa  90.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 1040 aa  90.1  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  29.15 
 
 		 1010 aa  90.1  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1011 aa  89.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  44.44 
 
 		 1088 aa  89.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1142 aa  89.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.29 
 
 		 1916 aa  88.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.82 
 
 		 2002 aa  87.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1074 aa  87.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1165 aa  87.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 1107 aa  87  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.28 
 
 		 1704 aa  86.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1041 aa  86.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 1050 aa  86.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1078 aa  85.9  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1098 aa  85.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  37.4 
 
 		 1153 aa  84.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1038 aa  84.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  36.81 
 
 		 1071 aa  84  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1051 aa  84.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.08 
 
 		 2173 aa  83.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  37.78 
 
 		 1063 aa  83.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  35.29 
 
 		 1058 aa  83.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.61 
 
 		 2195 aa  83.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1065 aa  82.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  31 
 
 		 1032 aa  82.8  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 1105 aa  82.8  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  40.78 
 
 		 1099 aa  82.8  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1135 aa  82.4  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  40.62 
 
 		 1059 aa  82.4  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1072 aa  82.4  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1109 aa  81.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1063 aa  81.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1083 aa  80.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1137 aa  80.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1033 aa  80.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1031 aa  80.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 1039 aa  80.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1093 aa  79.7  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.2 
 
 		 2002 aa  79.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1047 aa  79.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1068 aa  79.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1163 aa  79  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  34.42 
 
 		 1051 aa  78.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1081 aa  78.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 1049 aa  77.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 		 1044 aa  77.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1063 aa  77.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 1064 aa  76.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.41 
 
 		 2191 aa  76.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1155 aa  76.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1041 aa  75.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  32.06 
 
 		 1123 aa  75.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1119 aa  75.5  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1070 aa  75.5  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1008 aa  75.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1049 aa  75.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1071 aa  75.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1192 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1138 aa  74.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  30.77 
 
 		 1025 aa  74.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1012 aa  74.7  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1023 aa  74.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1098 aa  73.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.41 
 
 		 2058 aa  73.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 1045 aa  73.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1153 aa  73.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  34.59 
 
 		 1129 aa  73.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1084 aa  73.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 1166 aa  73.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1189 aa  72.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 996 aa  72.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1203 aa  72  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  31.13 
 
 		 1080 aa  72  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  29.7 
 
 		 1028 aa  71.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 986 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 1144 aa  71.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1036 aa  70.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32 
 
 		 1002 aa  70.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 1234 aa  70.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  37.6 
 
 		 1062 aa  70.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1021 aa  71.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>