271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6408 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  44.36 
 
 		 787 aa  651    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  43.23 
 
 		 790 aa  651    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  45.58 
 
 		 793 aa  684    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  53.8 
 
 		 775 aa  875    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  42.3 
 
 		 791 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 772 aa  1572    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  62.96 
 
 		 881 aa  1024    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  43.06 
 
 		 792 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  54.2 
 
 		 775 aa  896    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  42.62 
 
 		 780 aa  625  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  41.6 
 
 		 800 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  42.12 
 
 		 814 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  39.1 
 
 		 872 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  38.35 
 
 		 806 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  38.67 
 
 		 923 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  38.28 
 
 		 791 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  37.7 
 
 		 789 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  37.42 
 
 		 804 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 923 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  36.06 
 
 		 874 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 772 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 875 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  36.09 
 
 		 928 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 803 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 852 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  34.91 
 
 		 917 aa  439  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  33.38 
 
 		 800 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 786 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 753 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 756 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 831 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  26.73 
 
 		 888 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  23.25 
 
 		 866 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  22.87 
 
 		 860 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  22.87 
 
 		 859 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  22.41 
 
 		 859 aa  104  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  22.69 
 
 		 767 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 701 aa  95.5  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 779 aa  92.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 814 aa  90.5  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.98 
 
 		 897 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  22.96 
 
 		 865 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  25.19 
 
 		 791 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  21.36 
 
 		 906 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  25.93 
 
 		 821 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 777 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  29.67 
 
 		 827 aa  80.9  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  26.56 
 
 		 821 aa  79.3  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  23.3 
 
 		 822 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 771 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 797 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 902 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 800 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 769 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  29.69 
 
 		 1095 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 962 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 		 897 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 861 aa  64.3  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 763 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 1061 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 982 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 743 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1029 aa  62  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  26.14 
 
 		 802 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1085 aa  60.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 958 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 931 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  26.84 
 
 		 719 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1089 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 727 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1148 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  20.83 
 
 		 729 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1033 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 791 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 866 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1043 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 1050 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1051 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 993 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 993 aa  57.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1138 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1048 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1100 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  26.7 
 
 		 799 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  38.85 
 
 		 1075 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 		 993 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 1137 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 760 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1147 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1062 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1040 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 709 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1028 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 		 809 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1081 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1042 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>