More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0830 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  40.9 
 
 		 924 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 933 aa  1881    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 1090 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 962 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 1051 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 931 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 957 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 1077 aa  351  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 957 aa  343  8e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1003 aa  314  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 916 aa  229  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  24.48 
 
 		 894 aa  224  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 927 aa  219  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 917 aa  217  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 897 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 920 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 856 aa  213  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 897 aa  211  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 888 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 892 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 888 aa  195  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 922 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 897 aa  188  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 938 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  24.58 
 
 		 929 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 943 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 901 aa  166  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 935 aa  156  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 962 aa  140  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 946 aa  137  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 991 aa  135  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 917 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 1004 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 944 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1001 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 972 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 932 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 941 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 943 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 942 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 919 aa  119  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  30.12 
 
 		 972 aa  112  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 961 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 945 aa  105  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 936 aa  99  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 952 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 836 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 		 853 aa  84.7  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 842 aa  84.7  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  31.16 
 
 		 838 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1020 aa  82  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 1089 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  41.13 
 
 		 1062 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1033 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 894 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 1117 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.82 
 
 		 833 aa  75.1  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 971 aa  75.1  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  35.76 
 
 		 1047 aa  75.1  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 958 aa  74.7  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  44.44 
 
 		 935 aa  74.7  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 806 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 816 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  41.3 
 
 		 1107 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  34.03 
 
 		 1074 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  36.81 
 
 		 1095 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  43.88 
 
 		 1087 aa  72.8  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1028 aa  72  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1074 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 753 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 779 aa  71.6  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  27.2 
 
 		 782 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  37.93 
 
 		 1084 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 788 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  42.74 
 
 		 989 aa  70.5  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.51 
 
 		 848 aa  69.7  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 777 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1006 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1034 aa  70.1  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 933 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1147 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 979 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 889 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 897 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  29.67 
 
 		 799 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1085 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1064 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  29.94 
 
 		 1109 aa  68.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 958 aa  68.6  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  29 
 
 		 942 aa  67.8  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 881 aa  67  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 988 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 791 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1148 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  41.58 
 
 		 992 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 927 aa  67.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 1066 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1010 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1053 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1079 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>