161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1234 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 716 aa  1465    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  41.36 
 
 		 730 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  36.81 
 
 		 719 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2226  hypothetical protein  28.3 
 
 		 740 aa  268  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000689812 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  29.21 
 
 		 821 aa  85.1  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 792 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 		 775 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  27.04 
 
 		 821 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  37.89 
 
 		 1175 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  24.39 
 
 		 827 aa  68.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  21.92 
 
 		 753 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  24.7 
 
 		 872 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1070 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1089 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.29 
 
 		 833 aa  62.4  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 783 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.4 
 
 		 1063 aa  60.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 881 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  26.1 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 		 788 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 789 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 756 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 791 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  22.18 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 809 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1043 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 735 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1034 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 792 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.91 
 
 		 859 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1116 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1102 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  28.57 
 
 		 828 aa  55.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1036 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  24.88 
 
 		 888 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 888 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  22.12 
 
 		 902 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1064 aa  54.3  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 809 aa  54.3  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 882 aa  53.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 831 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1051 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  27.78 
 
 		 1030 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1071 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 772 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1040 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1048 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1062 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 		 797 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 804 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 874 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  30.09 
 
 		 816 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  25.82 
 
 		 803 aa  51.6  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1011 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1038 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 923 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 833 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 747 aa  51.2  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 929 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 814 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.27 
 
 		 750 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 866 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1033 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 790 aa  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 988 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 812 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 793 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1103 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  22.04 
 
 		 824 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1023 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1109 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1148 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1127 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 817 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 1144 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1048 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1013 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1006 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  21.69 
 
 		 993 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1098 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 803 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  27.18 
 
 		 979 aa  48.5  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 795 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 1101 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1064 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 1053 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1114 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1148 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1010 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 800 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1127 aa  47.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1020 aa  47.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1012 aa  47.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1040 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  20.23 
 
 		 800 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1152 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>