55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1606 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  100 
 
 		 802 aa  1645    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  35.33 
 
 		 821 aa  482  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  34.89 
 
 		 821 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  32.69 
 
 		 827 aa  422  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 		 792 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 814 aa  327  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 806 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 923 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 789 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 923 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 753 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 790 aa  84.3  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  22.91 
 
 		 772 aa  81.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  26.03 
 
 		 800 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  27.3 
 
 		 780 aa  79  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 874 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  24.32 
 
 		 872 aa  77.8  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 792 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 804 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 803 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 881 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 814 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 791 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 793 aa  71.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 786 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 875 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  22.76 
 
 		 800 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  27.1 
 
 		 888 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 756 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  21.6 
 
 		 831 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 852 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 772 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  24.9 
 
 		 928 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  21.95 
 
 		 779 aa  58.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  22.18 
 
 		 716 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 719 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  23.3 
 
 		 730 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  20.25 
 
 		 897 aa  51.6  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 760 aa  51.2  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  21.7 
 
 		 791 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  20.91 
 
 		 906 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 791 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 771 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  22.12 
 
 		 1079 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 797 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  20 
 
 		 902 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1028 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 851 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  22.81 
 
 		 1114 aa  45.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 800 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  28.35 
 
 		 799 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  21.31 
 
 		 777 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>