137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0030 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 786 aa  1605    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  40.76 
 
 		 803 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  38.06 
 
 		 923 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 923 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  38.45 
 
 		 793 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 791 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 790 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  34.49 
 
 		 928 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  34.97 
 
 		 917 aa  489  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 775 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 		 787 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  35.33 
 
 		 780 aa  471  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  37.15 
 
 		 814 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 800 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  35.03 
 
 		 872 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 881 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 775 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  33.12 
 
 		 800 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 792 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 772 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 791 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 789 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 806 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 874 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 804 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 875 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 772 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 852 aa  268  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 753 aa  242  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 756 aa  235  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 831 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  24.9 
 
 		 888 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  25.9 
 
 		 866 aa  125  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.07 
 
 		 859 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 897 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  22.04 
 
 		 860 aa  81.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  22.83 
 
 		 865 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 814 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  22.34 
 
 		 859 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  27.08 
 
 		 822 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  25.32 
 
 		 802 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 952 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 966 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  29.06 
 
 		 827 aa  64.3  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 888 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 760 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 730 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  27.01 
 
 		 791 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1038 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 792 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 753 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1022 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  21.11 
 
 		 906 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1051 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1033 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 747 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 797 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 1089 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 1117 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 865 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1206 aa  54.7  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1056 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  27.16 
 
 		 821 aa  54.3  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 734 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 779 aa  54.3  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  26.53 
 
 		 803 aa  53.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.63 
 
 		 1023 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 1039 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1087 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 994 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1059 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 733 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 757 aa  51.6  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  34.45 
 
 		 821 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 1059 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  24.79 
 
 		 1025 aa  51.6  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1036 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 1032 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1057 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  22.63 
 
 		 1048 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  22.96 
 
 		 771 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 760 aa  50.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 924 aa  50.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1071 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 935 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  21.72 
 
 		 714 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1123 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  24.56 
 
 		 719 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1116 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1023 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1115 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1109 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 708 aa  49.3  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 988 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 1177 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1081 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  25.72 
 
 		 767 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 762 aa  48.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>