212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5310 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  100 
 
 
791 aa  1612    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  39.81 
 
 
822 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  39.75 
 
 
797 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 
771 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  38.43 
 
 
800 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  37.07 
 
 
779 aa  469  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 
777 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  31.53 
 
 
767 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 
772 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.74 
 
 
859 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 
806 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 
804 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 
753 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  23.46 
 
 
875 aa  101  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
791 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  23.36 
 
 
872 aa  98.6  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
923 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  24.09 
 
 
865 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  26.09 
 
 
780 aa  95.5  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 
775 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  22.81 
 
 
789 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  21.29 
 
 
800 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.26 
 
 
860 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 
923 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  22.05 
 
 
874 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 
881 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 
935 aa  87.4  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 
772 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  22.58 
 
 
859 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 
814 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 
787 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 
800 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  21.84 
 
 
917 aa  82  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 
790 aa  81.6  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 
792 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  22.65 
 
 
906 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
931 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 
793 aa  77.8  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 
831 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  22.24 
 
 
775 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  25.49 
 
 
1109 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  22.26 
 
 
803 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 
865 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
852 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  28.46 
 
 
1126 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  28.08 
 
 
1120 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  28.08 
 
 
1122 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 
966 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  22 
 
 
730 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  22.73 
 
 
729 aa  67.4  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
933 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
897 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
1001 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 
962 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
1089 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.83 
 
 
897 aa  62  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
933 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 
781 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  29.17 
 
 
1067 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.06 
 
 
1032 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 
893 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 
786 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 
743 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 
920 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 
727 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 
888 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 
828 aa  58.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
991 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  25.47 
 
 
928 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 
993 aa  57.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  37.72 
 
 
828 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  27.24 
 
 
1052 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
957 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
1090 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 
1014 aa  57.8  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  36.75 
 
 
1057 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  22.16 
 
 
888 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 
1003 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 
798 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
1036 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 
814 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.41 
 
 
833 aa  54.7  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  21.79 
 
 
781 aa  54.7  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 
1147 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 
1066 aa  54.7  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 
1094 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 
1075 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 
1010 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 
986 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 
1066 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 
747 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  30.89 
 
 
1074 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
821 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 
1060 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  24.18 
 
 
827 aa  53.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 
952 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  23.32 
 
 
1071 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 
1082 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  25 
 
 
756 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  29.72 
 
 
1237 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>