222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4830 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 771 aa  1582    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  43.19 
 
 		 797 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 800 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  38.71 
 
 		 791 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  35.93 
 
 		 822 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 779 aa  476  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 777 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  34 
 
 		 767 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  24.25 
 
 		 772 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  22.96 
 
 		 753 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 875 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 935 aa  90.5  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  23.93 
 
 		 872 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 806 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 789 aa  89  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 852 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  25.38 
 
 		 859 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 792 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 923 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 923 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 787 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 831 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  25.33 
 
 		 917 aa  80.1  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 897 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  25.86 
 
 		 780 aa  77.8  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 1089 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  24.34 
 
 		 906 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 791 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  22.36 
 
 		 874 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.26 
 
 		 800 aa  75.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  39.18 
 
 		 931 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 804 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 897 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 791 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 814 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 772 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 800 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 790 aa  72  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  25.4 
 
 		 928 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  23.09 
 
 		 719 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 814 aa  70.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1001 aa  70.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  22.95 
 
 		 775 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1126 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1120 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1122 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 938 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 793 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1109 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  20.98 
 
 		 888 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 865 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  38.04 
 
 		 1075 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  39.22 
 
 		 962 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 845 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  38.68 
 
 		 793 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 828 aa  65.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 991 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 781 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  27.73 
 
 		 827 aa  64.3  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 966 aa  64.3  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 1004 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1147 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1087 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 888 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 893 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  22.39 
 
 		 775 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 881 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 836 aa  60.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 952 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 933 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1082 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 924 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  22.85 
 
 		 821 aa  57.4  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1066 aa  57.4  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 986 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  22.36 
 
 		 803 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 927 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 957 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1022 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  26.98 
 
 		 1065 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 957 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1041 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 932 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1039 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  31.03 
 
 		 833 aa  55.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 920 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 999 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  23.42 
 
 		 859 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.42 
 
 		 860 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 798 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 747 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 792 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  37.17 
 
 		 1010 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 776 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  20.24 
 
 		 701 aa  54.3  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 933 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6060  WD40 domain protein beta Propeller  34.71 
 
 		 510 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>