More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4371 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 874 aa  1794    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  40.66 
 
 		 875 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  42.96 
 
 		 804 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  41.68 
 
 		 789 aa  615  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  40.8 
 
 		 806 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  36.42 
 
 		 775 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 		 775 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  37.2 
 
 		 772 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 881 aa  476  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 792 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 787 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 814 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  32.26 
 
 		 800 aa  419  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 793 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 790 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 791 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  32.2 
 
 		 780 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  28.85 
 
 		 872 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 852 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 753 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 923 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 923 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  30.17 
 
 		 917 aa  359  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 791 aa  350  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 803 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  26.95 
 
 		 928 aa  337  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 786 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 756 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  29.48 
 
 		 888 aa  296  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 800 aa  293  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 831 aa  274  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  24.03 
 
 		 866 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  24.43 
 
 		 906 aa  154  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  26.53 
 
 		 859 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 800 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  22.87 
 
 		 865 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 779 aa  111  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  22.6 
 
 		 797 aa  104  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 701 aa  99  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.34 
 
 		 860 aa  98.2  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22.2 
 
 		 791 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  24.19 
 
 		 859 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 814 aa  91.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  22.14 
 
 		 777 aa  89.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  22.48 
 
 		 771 aa  88.2  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 902 aa  87.8  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.43 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  23.48 
 
 		 767 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 897 aa  84.3  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 865 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  25.2 
 
 		 822 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  28.81 
 
 		 827 aa  78.6  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  25.48 
 
 		 821 aa  78.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  24.79 
 
 		 802 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 935 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1142 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 1090 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1089 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1087 aa  70.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 792 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1094 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 1148 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1146 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1147 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1119 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  22.51 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 933 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1188 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1138 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 1190 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 1177 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1076 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1023 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1100 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1138 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1106 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 874 aa  62.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1060 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  19.68 
 
 		 897 aa  62  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1092 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 1154 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1173 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1155 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1160 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1148 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  21.85 
 
 		 719 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1181 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1109 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1102 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1120 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1020 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 1050 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1163 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 1144 aa  58.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1122 aa  58.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 1127 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1114 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 836 aa  57.4  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1130 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>