More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2829 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 803 aa  1648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 923 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  39.82 
 
 		 800 aa  579  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  40.76 
 
 		 786 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 793 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 923 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  39.31 
 
 		 787 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  39.06 
 
 		 814 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  36.7 
 
 		 775 aa  515  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 790 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  37.32 
 
 		 917 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  37.15 
 
 		 780 aa  504  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  36.69 
 
 		 928 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 791 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  35.81 
 
 		 800 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  36.74 
 
 		 872 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 792 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 		 881 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 791 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 772 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 775 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 806 aa  350  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 874 aa  336  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 789 aa  330  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 852 aa  324  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 804 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 875 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 772 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 753 aa  265  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 756 aa  223  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 831 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  25.12 
 
 		 888 aa  164  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 814 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  23.29 
 
 		 866 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  30.64 
 
 		 821 aa  97.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.8 
 
 		 860 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  23.63 
 
 		 859 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21 
 
 		 701 aa  89.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 1089 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  23.97 
 
 		 865 aa  84.7  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  26.72 
 
 		 859 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 792 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  25.64 
 
 		 821 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  23.32 
 
 		 802 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22.34 
 
 		 791 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  24.82 
 
 		 767 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 902 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 897 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1053 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1066 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1101 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  29.46 
 
 		 993 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 935 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1129 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 763 aa  68.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1148 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1063 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1077 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1052 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1059 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1072 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1137 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 1175 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1173 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 966 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 888 aa  64.3  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  26.4 
 
 		 827 aa  63.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1147 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1075 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 760 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1165 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 882 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1104 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1142 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  25.34 
 
 		 803 aa  62.4  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1034 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1079 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1181 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1051 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.35 
 
 		 848 aa  62  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  21.63 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 924 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1048 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1058 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 1040 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 986 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  20.73 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1020 aa  61.2  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1105 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1138 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1122 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1038 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1050 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1100 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 933 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 1011 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1153 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1115 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>