More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7106 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 818 aa  1669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 		 763 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  36.43 
 
 		 811 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  37.18 
 
 		 824 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 735 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 759 aa  334  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 801 aa  270  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 776 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 730 aa  238  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 678 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  26.17 
 
 		 776 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 780 aa  202  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  25.54 
 
 		 799 aa  194  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 758 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  25.52 
 
 		 758 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  25.61 
 
 		 758 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  25.27 
 
 		 758 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 689 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 689 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 730 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 707 aa  114  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 705 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 699 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 747 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 694 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 742 aa  105  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 677 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 719 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 694 aa  103  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 733 aa  103  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 714 aa  101  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 692 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 705 aa  100  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 693 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 719 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 751 aa  99.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 676 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 709 aa  98.6  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 724 aa  98.6  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 677 aa  98.6  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 753 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 757 aa  96.3  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 732 aa  96.3  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  22.66 
 
 		 714 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.65 
 
 		 600 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 709 aa  95.9  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  37.18 
 
 		 706 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 695 aa  92  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 693 aa  90.5  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 727 aa  89  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 681 aa  87.8  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  33.55 
 
 		 681 aa  87.8  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 924 aa  87.4  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.96 
 
 		 833 aa  86.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 744 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 918 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 780 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 685 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 821 aa  85.5  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  31.84 
 
 		 788 aa  84.7  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 679 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 734 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 760 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 861 aa  82  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 962 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 702 aa  80.5  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 769 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.27 
 
 		 693 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  21.49 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 715 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  33.86 
 
 		 652 aa  79  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  23.6 
 
 		 713 aa  78.2  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1075 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 719 aa  78.2  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  22.26 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 933 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.03 
 
 		 696 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 854 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1003 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 760 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 723 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 776 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 698 aa  76.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 778 aa  76.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  24.33 
 
 		 712 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 731 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 797 aa  75.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.2 
 
 		 698 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 833 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.64 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 766 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  28.24 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.68 
 
 		 630 aa  74.7  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 708 aa  74.7  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.68 
 
 		 630 aa  74.7  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  29 
 
 		 750 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 835 aa  74.3  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  28.24 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>